废旧的船通常指位于稻妻地区清籁岛的清籁丸残船或枫丹伊黎耶林区的废弃船骸。进入这些船只需要完成特定的解谜或收集钥匙，具体方法因船只位置而异。清籁丸残船需通过传送点抵达船舱位置，随后破解机关；而伊黎耶林区的船骸则需收集三把钥匙才能开启被锁的房间。
进入清籁丸残船需先传送到清籁丸附近的锚点，随后进入船舱二楼控制室。控制室内设有旋转机关，需逆时针操作一次以激活解谜。完成机关操作后，可开启宝箱并获得奖励。接着进入船舱第三层，需踩亮地面所有黑暗方块以解锁后续区域。最后击破二、三层的全部机关，即可完成解密并获取雷之印等奖励。过程中需注意跟随仙灵指引，部分区域需借助雷种子穿越结界。
首先需传送至伊黎耶林区东岸锚点，向西行进找到船骸。第一把钥匙需击败船内甲板的盗宝团并开启宝箱获取；第二把钥匙位于船骸顶端的鸟窝旁，调查发光点即可获得；第三把钥匙需转向船骸后方岸边，在沉船处的旅行包旁搜索。集齐三把钥匙后，返回船骸门口的火把处即可解锁房间，内含珍贵宝箱和神瞳。
部分废弃船只的进入需结合环境互动。例如清籁丸残船需利用相位之门和雷种子跨越障碍，而稻妻名椎滩的废弃大船则需先击杀周围怪物激活传送点。若遇到无法直接进入的船舱，建议检查是否有遗漏的机关或未触发的任务条件。部分船舱内部存在多层结构，需按顺序破解才能完全探索。
